La Fondazione Centro Ricerche Marine opera in conformità alla norma UNI CEI EN ISO/IEC 17025 ed ha formalmente ottenuto l'accreditamento nel 2003. Il certificato di accreditamento N. 00419 (ex 0472L) è stato rinnovato nel 2007, nel 2011, nel 2015, nel 2019 e nel 2023.